Фёдор Алексеевич Смирнов родился 8/ 20 февраля 1842 года в семье диакона с. Вешки, Юхновского уезда (ныне Угранского района), Смоленской губернии.
В 1859 году Фёдор Смирнов поступил в Смоленскую духовную семинарию, по окончании которой в 1865 году первым учеником направлен в Киевскую духовную академию, которую успешно окончил 1869 году.

2 декабря 1870 года ему присвоили степень магистра богословия. Около года Фёдор Алексеевич занимал должность помощника инспектора в Смоленской духовной семинарии.
30 января 1871 года его перевели доцентом в Киевскую духовную академию на кафедру археологии и литургики.

Первую статью Фёдора Алексеевича «Богослужение апостольского времени» опубликовали в 1873 году в № 5 «Трудов Киевской духовной академии». В связи с открытием Церковно-археологического музея при Киевской духовной академии и усилением деятельности Археологического общества в Киеве Фёдор Алексеевич стал заниматься церковной археологией. С 1877 по 1881 годы в «Трудах академии» опубликовали его работу «Описание коллекции древних русских икон, приобретённых Церковно-археологическим обществом».

С 28 октября 1877 года Фёдор Алексеевич — экстраординарный профессор Киевской академии.

В «Киевских епархиальных ведомостях» № 6 за 1883 год сообщалось:

«экстра-ординарный профессор Киевской духовной академии по кафедре церковной археологии Фёдор Алексеевич Смирнов изъявил намерение поступить в монашество и 27 марта в Киево-Печерской Лавре совершилось его пострижение с именем Христофора».

13 апреля того же года монаха Христофора рукоположили в сан иеродиакона и 14 апреля – в сан иеромонаха.
В мае (по другим источникам 3 июня) 1883 года по определению Свщенного Синода иеромонаха Христофора назначили ректором Тамбовской Духовной семинарии, а 17 июля возвели в сан архимандрита.
13 июня 1885 года архимандрита Христофора переместили на должность ректора Вифанской духовной семинарии, находившейся недалеко от Троице-Сергиевой Лавры.
30 июля 1886 года его назначили ректором Московской Духовной Академии.

24 апреля 1887 года император Александр III утвердил доклад Синода о возведении архимандрита Христофора в епископа Волоколамского, третьего викария Московской епархии, и о совершении хиротонии архимандрита Христофора в Свято-Троицкой Сергеевой Лавре.

25 мая в Успенском соборе Лавры произошла хиротония архимандрита Христофора во епископа Волоколамского.
13 декабря 1890 года его освободили от управления епархией и ректорства и назначили управляющим Воскресенским Новоиерусалимским монастырем.
С 19 декабря 1892 года преосвященный Христофор — епископ Ковенский, викарий Литовской епархии.
С 6 июня 1897 года он епископ Екатеринбургский и Ирбитский.
С 29 марта 1900 года владыка Христофор — епископ Каменец-Подольский.
С 26 ноября 1903 года он епископ Уфимский и Мензелинский.

17 октября 1908 года его уволили на покой по болезни, согласно прошению, с местопребыванием в Вяземском Иоанно-Предтечевом мужском монастыре Смоленской епархии.
Скончался преосвященный Христофор после 1918 года. Вероятно, что был погребен на территории Иоанно-Предтечева монастыря.
Духовный писатель. Публиковался в журналах: «Воскресный благовест», «Душеполезное чтение», «Екатеринбургские епархиальные ведомости», «Православное обозрение», «Смоленские епархиальные ведомости», «Труды Киевской духовной академии», «Уфимские епархиальные ведомости», «Церковный вестник».
Его обычная резолюция на деловых бумагах: «В Крию на рие» (т.е. «в Консисторию на рассмотрение»).

Литература:

1. ГАСО. Ф. 49. Оп. 1. Д. 3. Л. 33.

2. История иерархии Русской Православной Церкви. Комментированные списки иерархов по епископским кафедрам с 862 г. ПСТГУ. М., 2006. С. 513, 814.

3. Наречение архимандрита Христофора во епископа // СЕВ. 1887. № 11. С. 521-532.

4. Отзывы епархиальных архиереев по вопросу о церковной реформе. Часть вторая. М., 2004. С. 1042.